Leczenie kanałowe stomatolog endodonta realizuje z reguły w najcięższych przypadkach. Zwykle leczenie kanałowe niezbędne będzie w sytuacji, kiedy miazga zęba została głęboko zaatakowana przez bakterie i próchnicę, a więc ząb niszczy się od wewnątrz. Często przyczyną podejmowanego w gabinecie stomatologicznym zabiegu endodontycznego są martwica i zgorzele miazgi oraz zmiany okołowierzchołkowe, obumarcie lub głębokie starcie zębów. Bywa tak, że leczenie kanałowe pod mikroskopem należy podjąć, jeśli np. na skutek urazu dochodzi do odsłonięcia miazgi zębowej.
Są również takie przypadki leczenia kanałowego, które nie są skutkiem chorób czy urazów. Przykładem tego może być błędnie przeprowadzony wcześniej zabieg, po jakim w kanale zębowym zostało złamane narzędzie dentystyczne. Stomatolog endodonta postara się zadziałać także w przypadku niedrożności kanału. Niedrożność zazwyczaj występuje na skutek zwężenia lub zrośnięcia się kanałów, nietypowego przebiegu lub z uwagi na jego błędne wypełnienie. Czasem leczenie kanałowe potrzebne jest także po zdjęciu koronowo-korzeniowego wkładu.
Leczenia endodontycznego nie należy się bać, niezależnie od problemu, z którym pacjent zgłasza się do stomatologa endodonty. We współczesnej stomatologii właściwie każdy zabieg przeprowadzany jest pod znieczuleniem, dlatego zabiegi zupełnie nie bolą. O wiele lepiej zgłosić się do stomatologa, żeby coś zaradził i wykonał leczenie, niż pozwolić na dalszy rozwój problemu.