To, czy można leczyć zęby w ciągu leczenia aparatem na zęby, przede wszystkim ciekawi pacjentów, którzy mają założony aparat stały. Nie można zdejmować go samemu, ze względu na to w obecności problemów konieczna jest wizyta w gabinecie dentysty ortodonty. Przed rozpoczęciem leczenia aparatem ortodontycznym każdy pacjent musi zatroszczyć się o to, by jego zęby były w pełni wyleczone. W taki sposób zmniejsza się ryzyko nadwyżkowych wizyt naprawczych w ciągu leczenia aparatem na zęby. Nie ma jednak przeciwwskazań do leczenia zębów, gdy pacjent ma stały aparat na zęby.
Korzystanie z aparatu wiąże się ze zwiększoną potrzebą troski o zęby. Ze względu na przyklejone na zębach zamki oraz pozostałe fragmenty konstrukcji aparatu , wymiatanie osadów i resztek jedzenia staje się nieco trudniejsze. To oznacza, że pacjenci korzystający z leczenia ortodontycznego muszą uważniej myć zęby, szczególnie w pobliżu aparatu na zęby. Niedopilnowanie higieny w tym czasie, może spowodować, że na wcześniej zdrowych zębach pojawią się próchnicowe zmiany. W tej sytuacji należy wybrać się na wizytę u stomatologa. Zignorowanie psucia się zębów ze względu na aparat ortodontyczny może wywołać nieprzyjemne skutki. Próchnica bez trudu przenosi się na następne zęby, więc bezpieczniej zniwelować problem.
Leczenie w ciągu korzystania z aparatu jest dostępne. Jeżeli aparat uniemożliwia dostęp do popsutego zęba, można go ściągnąć na czas naprawy. Ten zabieg nie przeszkodzi w skuteczności leczenia ortodontycznego.